蛋白質分子在溶液中並非靜態的，而是具有非常複雜的動態行為，這些動態行為對於其生物功能有非常重要的影響，例如酵素的催化、蛋白質摺疊以及配位鍵結等。利用NMR鬆弛實驗，可以在特定的時間尺度下(毫秒至微秒)獲得蛋白質的動態資訊。特別是，慢交換動力學資訊可以經由CPMG或自旋鎖定下的鬆弛分散曲線而得到。前面我們已經利用自己新設計的異核二維光譜脈衝序列得到了分散曲線與CPMG間隔和偏置的關係，本工作將探討溶液酸鹼性對分散曲線之影響。另外，為了系統分析二級三級結構對蛋白質慢交換動力學行為的影響，我們也對單個氨基酸的動態行為作了研究。透過研究不同pH值下氨基酸中的13C的單量子相干之鬆弛，可得出單量子相干的有效鬆弛速率與脈衝間隔及相關時間的函數關係，以探討pH值對氨基酸動態的影響。同樣的實驗在實際蛋白質Ubiquitin上進行。由這些結果可以獲取氨基酸的性質（親水/疏水/帶電/酸鹼性/鏈長等）以及二級三級結構如何影響動力學行為。

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第一章 緒論..................................................1
一、 氨基酸簡介...........................................2
二、 泛素(Ubiquitin)簡介..................................6
第二章 CPMG實驗測量交換鬆弛..................................8
一、 橫向鬆弛及CPMG測量..................................8
二、 鬆弛分散實驗.........................................11
三、 蛋白質動力學簡介.....................................12
1.與模型無關方法.....................................13
2.化學交換動力學.....................................17
第三章 實驗部份..............................................26
一、 實驗藥品.............................................26
二、 樣品的製備...........................................26
三、 儀器設備.............................................27
四、 實驗條件.............................................27
五、 泛素13Cα-H的多量子鬆弛分散實驗.......................28
第四章 結果與討論............................................31
一、 各類型胺基酸在不同pH值的鬆弛散曲線..................31
二、 改變偏置對鬆弛分散曲線的影響.........................37
三、 改變溫度對鬆弛分散曲線的影響.........................47
四、 泛素的多量子相干鬆弛分散曲線.........................55
五、 氨基酸鬆弛分散曲線之模擬.............................59
第五章 總結與未來展望.......................................64
第六章 參考文獻..............................................66

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