目前為止已有廣泛的報導有關於含聚醯胺之凹槽鍵結試劑。我們合成具有吡咯啶化合物來取代distamycin其中之一的吡咯環，並且探討具有光學活性的飽和雜環化合物對結構造成的影響。

Polyamide containing groove binding agents have been widely reported. We synthesized pyrrolidine to displace one of pyrrole of distamycin, and research into structure which was effected by optical and saturated heterocycle.

目錄
第一章具有光學活性的飽和雜環化合物對DNA序列的影響
1-1 序論…………………………………………………………1
1-2自然界的DNA小凹槽鍵結試……………….......................2
1-3具有彈性連結化合物的Net衍生物………………………..5
1-4以多胜肽飽和環化合物所構成的Dist衍生物....................15
1-5光學活性對DNA鍵結的選擇性…………………………..18
第二章 具光學活性Distamycin衍生物的合成探討
2-1研究動機…………………………………………………….26
2-2 建構具有光學活性的Distamycin衍生物………………29
2-2-1 Distamycin衍生物之前趨物及中間體的製備…………..29
2-2-2 以中間體合成各式具有光學活性的Distamycin衍生物…33
2-3 DNA的熔點測試…………………………………………38
2-4 Fluorescence實驗………………………………………….44
2-5 結論…………………………………………………………45
參考資料………………………………………………………….88






圖 目

第一章 飽和雜環化合物以及具有光學活性對DNA序列的影響

圖一 Distamycin 和 Netropsin 2
圖二 Netropsin和A-T鹼基對鍵結圖 3
圖三 Distamycin 2:1結合模型 3
圖四 頭對頭連接試劑 5
圖五 恰當的距離 6
圖六 連接試劑的彈性度 6
圖七 形狀造成鍵結的差異 6
圖八 鍵結構形的穩定度 7
圖九 剛硬和彈性的連接試劑造成的鍵結型態 8
圖十 跳舞機制 8
圖十一 兩個胺基氫的距離 9
圖十二 反式環丙烷conformation plots 9
圖十三 順式連結化合物的鍵結型態(一) 10
圖十四 順式連結化合物的鍵結型態(二) 11
圖十五 順式環丙烷conformation plots 11
圖十六 六圓環連接試劑 12
圖十七 五圓環連接試劑 13
圖十八 雙鍵型態的連接試劑 14
圖十九 Distamycin雜環衍生物 15
圖二十 取代EtBr示意圖 15
圖二十一 多胺基化合物 18
圖二十二 多胺基化合物與DNA鍵結的示意圖 18
圖二十三 髮夾式多胜肽化合物 21
圖二十四 分子平衡作用力示意圖 22
圖二十五 SP-濃度圖 22
圖二十六 針對配對或位配對化合物分子平衡作用力的探討 23
圖二十七 以配對化合物增加未配對化合物的靈敏度 24

第二章 具光學活性的Distamycin衍生物的合成探討

圖一 distamycin和其衍生物 26
圖二 (S,S)和(S,R)-distamycin衍生物 27
圖三 排列組合 (S,S)-distamycin衍生物 28
圖四 不同構形的(S,S)-distamycin衍生物 28
圖五 單吡咯啶雙吡咯環靜電基 33
圖六 (2S,4R)-單吡咯啶雙吡咯環靜電基 35
圖七 單吡咯啶雙吡咯環靜電基 35
圖八 各個Distamycin衍生物和其代號 38
圖九 CT-DNA ΔTm圖 40
圖十 Dst ΔTm圖 40
圖十一Net ΔTm圖 41
圖十二SSPrO ΔTm圖 41
圖十三SRPrOΔTm圖 42
圖十四 PrO2Py ΔTm圖 42
圖十五 2PyPrOΔTm圖 43
圖十六 Dst和其衍生物的ΔTm圖 43
圖十七 Fluorescence實驗 44
圖十八 SSPrO分子內氫鍵示意圖 45
圖十九 多胺化合物 46













表 目

第一章 飽和雜環化合物以及具有光學活性對DNA序列的影響

表一 C50的濃度值 16
表二 1-5Dst衍生物和髮夾式DNA的F1/F100%的比例 17
表三 多胺基化合物的DNA熔點實驗 19
表四 R或S組態的6和7DNA熔點實驗 24

第二章 具光學活性的Distamycin衍生物的合成探討

表一 ΔTm值 39









流 程 目

第二章 具光學活性的Distamycin衍生物的合成探討

流程一 羧酸之吡咯環化合物的製備 29
流程二 N-Boc吡咯啶環化合物的製備 30
流程三 (2S,4S)-疊氮吡咯啶化合物的製備 30
流程四 (2S,4R)-疊氮吡咯啶化合物的製備 31
流程五 吡咯環靜電基化合物的製備 31
流程六 雙醯胺雙吡咯環靜電基15的製備 32
流程七 (2S,4S)-吡咯吡咯啶18的製備 34
流程八 (2S,4S)-單吡咯啶雙吡咯環靜電基21的製備 34
流程九 2PyPrOMe的製備 36
流程十 2PyPrO的製備 36
流程十一 PrO2Py的製備 37

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