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博碩士論文 etd-0905104-171758 詳細資訊
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論文名稱
Title
利用核磁共振弛豫方法研究蛇毒蛋白CTXn之動力學
The Dynamics of Protein CTXn from NMR Relaxation Studies
系所名稱
Department
畢業學年期
Year, semester
語文別
Language
學位類別
Degree
頁數
Number of pages
69
研究生
Author
指導教授
Advisor
召集委員
Convenor
口試委員
Advisory Committee
口試日期
Date of Exam
2004-06-16
繳交日期
Date of Submission
2004-09-05
關鍵字
Keywords
核磁共振、蛇毒蛋白、動力學
NMR, CTXn, dynamics
統計
Statistics
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中文摘要
蛋白質在溶液中並非靜態的,而是具有非常複雜的動態(dynamics)行為。這些分子內的運動對蛋白質的功能具有重大影響,例如扮演生物功能的殘基,常具有較大的靈活性。使用核磁共振弛豫(NMR relaxation)方法可測量蛋白質分子內每個殘基的局部運動,以及整個蛋白質分子的整體運動。本研究藉由測量眼鏡蛇毒蛋白CTXn中α-13C的縱向鬆弛時間(T1),橫向鬆弛時間(T2),1Hα -13Cα NOE,可求得三個運動參數,全轉動相關時間參數τm描述分子在溶液中翻滾的速度,有效相關時間τe描述分子內運動的速度,序參數S2描述各殘基運動的有序度。上述運動參數隨殘基所在位置(結構區和無規區)以及殘基的種類而改變。
Abstract
none
目次 Table of Contents
壹、緒論…………………………………………………………………..1
一、氨基酸簡介…………………………………………………….1
二、蛇毒簡介……………………………………………………….5
三、心臟蛇毒蛋白簡介…………………………………………….6
四、心臟蛇毒蛋白CTXn…………………………………………..7
貳、核磁共振弛豫理論………………………………………………….9
一、晶格-自旋弛豫………………………………………………10
二、自旋-自旋弛豫………………………………………………11
三、T1的測量方法…………………………………………………12
四、T2的測量方法…………………………………………………13
五、T1ρ的測量方法……………………………………………….15
六、Steady-State Nuclear Overhauser Effect………………………16
參、蛋白質動態行為之研究……………………………………………18
一、分子的運動……………………………………………………18
二、蛋白質的運動…………………………………………………20
三、與模型無關方法………………………………………………21
四、異核核磁共振弛豫……………………………………………27
五、非線性分析方法………………………………………………29
肆、二維異核核磁共振實驗簡介………………………………………32
一、INEPT…………………………………………………………32
二、HSQC………………………………………………………….33
三、α-13C的T1二維實驗………………………………………..34
四、α-13C的T2二維實驗………………………………………...35
五、Hα -13Cα NOE二維實驗………………………………………36
伍、實驗部分……………………………………………………………37
一、實驗藥品………………………………………………………37
二、樣品的製備……………………………………………………37
三、儀器設備及裝置………………………………………………37
四、核磁共振實驗…………………………………………………37
陸、結果與討論…………………………………………………………39
一、質子化學位移的判定…………………………………………39
二、α-13C化學位移的判定……………………………………….46
三、α-13C的T1實驗測量結果…………………………………….49
四、α-13C的T2實驗測量結果………………………………….....56
柒、總結…………………………………………………………………65
捌、未來展望……………………………………………………………66
玖、參考文獻……………………………………………………………67
附錄……………………………………………………………..………69
發表記錄
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