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論文名稱 Title |
利用核磁共振弛豫方法研究蛇毒蛋白CTXn之動力學 The Dynamics of Protein CTXn from NMR Relaxation Studies |
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系所名稱 Department |
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畢業學年期 Year, semester |
語文別 Language |
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學位類別 Degree |
頁數 Number of pages |
69 |
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研究生 Author |
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指導教授 Advisor |
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召集委員 Convenor |
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口試委員 Advisory Committee |
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口試日期 Date of Exam |
2004-06-16 |
繳交日期 Date of Submission |
2004-09-05 |
關鍵字 Keywords |
核磁共振、蛇毒蛋白、動力學 NMR, CTXn, dynamics |
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統計 Statistics |
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中文摘要 |
蛋白質在溶液中並非靜態的,而是具有非常複雜的動態(dynamics)行為。這些分子內的運動對蛋白質的功能具有重大影響,例如扮演生物功能的殘基,常具有較大的靈活性。使用核磁共振弛豫(NMR relaxation)方法可測量蛋白質分子內每個殘基的局部運動,以及整個蛋白質分子的整體運動。本研究藉由測量眼鏡蛇毒蛋白CTXn中α-13C的縱向鬆弛時間(T1),橫向鬆弛時間(T2),1Hα -13Cα NOE,可求得三個運動參數,全轉動相關時間參數τm描述分子在溶液中翻滾的速度,有效相關時間τe描述分子內運動的速度,序參數S2描述各殘基運動的有序度。上述運動參數隨殘基所在位置(結構區和無規區)以及殘基的種類而改變。 |
Abstract |
none |
目次 Table of Contents |
壹、緒論…………………………………………………………………..1 一、氨基酸簡介…………………………………………………….1 二、蛇毒簡介……………………………………………………….5 三、心臟蛇毒蛋白簡介…………………………………………….6 四、心臟蛇毒蛋白CTXn…………………………………………..7 貳、核磁共振弛豫理論………………………………………………….9 一、晶格-自旋弛豫………………………………………………10 二、自旋-自旋弛豫………………………………………………11 三、T1的測量方法…………………………………………………12 四、T2的測量方法…………………………………………………13 五、T1ρ的測量方法……………………………………………….15 六、Steady-State Nuclear Overhauser Effect………………………16 參、蛋白質動態行為之研究……………………………………………18 一、分子的運動……………………………………………………18 二、蛋白質的運動…………………………………………………20 三、與模型無關方法………………………………………………21 四、異核核磁共振弛豫……………………………………………27 五、非線性分析方法………………………………………………29 肆、二維異核核磁共振實驗簡介………………………………………32 一、INEPT…………………………………………………………32 二、HSQC………………………………………………………….33 三、α-13C的T1二維實驗………………………………………..34 四、α-13C的T2二維實驗………………………………………...35 五、Hα -13Cα NOE二維實驗………………………………………36 伍、實驗部分……………………………………………………………37 一、實驗藥品………………………………………………………37 二、樣品的製備……………………………………………………37 三、儀器設備及裝置………………………………………………37 四、核磁共振實驗…………………………………………………37 陸、結果與討論…………………………………………………………39 一、質子化學位移的判定…………………………………………39 二、α-13C化學位移的判定……………………………………….46 三、α-13C的T1實驗測量結果…………………………………….49 四、α-13C的T2實驗測量結果………………………………….....56 柒、總結…………………………………………………………………65 捌、未來展望……………………………………………………………66 玖、參考文獻……………………………………………………………67 附錄……………………………………………………………..………69 發表記錄 |
參考文獻 References |
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